We behandelen hier de situatie dat een woning deels voor de onderneming wordt gebruikt. Denk bijvoorbeeld aan een woning waarin ook een kantoor of atelier is gevestigd. Als een deel van een woning voor de onderneming wordt gebruikt, is hiervoor fiscale aftrek alleen mogelijk als sprake is van een zelfstandig deel (eigen opgang, eigen sanitair etc.).

De bezitter van een eigen woning wordt aangeslagen voor een forfaitaire netto huurwaarde. Daarin zijn kosten, zoals van onderhoud en verzekering, verwerkt.

De sinds 2004 bestaande bijleenregeling kan de fiscale voordelen van de woningfinanciering danig beperken. Iemand die bij de verkoop van de oude woning een forse overwaarde realiseert, kan immers slechts een deel van de koopsom van de nieuwe woning in box 1 financieren. Als het een ondernemer betreft die de nieuwe woning deels als kantoor- of praktijkruimte gaat gebruiken, kan hij ter vermijding van de bijleenregeling overwegen de woning geheel tot het fiscale ondernemingsvermogen te rekenen. De bijleenregeling geldt namelijk niet in de ondernemingssfeer. Nadeel hiervan is wel dat de toekomstige waardestijging fiscaal beclaimd gaat worden. Dit nadeel moet men afwegen tegen het voordeel van de volledige renteaftrek. Aangezien het optimisme ten aanzien van waardestijging van woningen e.d. nogal is afgenomen, zal aan dit minpunt tegenwoordig minder zwaar worden getild dan vroeger.